[세무] 지급명세서 불부합 소명하기 | 실제 4월 초 홈택스에 뜬 사례, 해결방법

안녕하세요.
오늘의 업무기록은 직접겪은 지급명세서 불부합 소명하기입니다.
작년에 대한 모든 지급명세서 신고가 마무리가 되면
4월 초에 지급명세서 불부합 이라는 창을 볼 수 있습니다. 물론 잘못할 경우에 뜨는 안내문입니다.

저의 사례를 예를들자면
2024년, 23년에대한
3월 법인세 신고를 한 후에
4월초에 뜨는 ”지급명세서 불부합“
홈택스에 지급명세서 불부합 이라는 팝업이 떴네요.

지급명세서 관련해 소명을 하게 되었는데
조금이라도 도움이 될까해서 남기는 포스팅입니다.

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“지급명세서 불부합” 이란?

이는 국세청이 보유한 근로자·사업자의 소득자료와 회사가 신고한 지급명세서가 일치하지 않을 때 발생하는데요.

불부합이 지속되면 근로자의 세금 신고에도 영향을 미치고, 경우에 따라 가산세 부과 및 세무조사 대상이 될 가능성도 존재합니다. 따라서 지급명세서 불부합이 발생하는 원인을 파악하고, 빠르게 수정하는 것이 중요합니다.

이번 글에서는 기업이 알아야 할 지급명세서 불부합 원인과 해결 방법을 정리해 보겠습니다.

1. 지급명세서 불부합이란?

지급명세서 불부합이란 회사(법인·개인사업자)가 국세청에 제출한 지급명세서와 국세청이 보유한 자료 또는 근로자가 신고한 연말정산 자료 간에 차이가 발생하는 것을 의미합니다.

✅ 불부합 발생 시 기업이 받는 영향
•가산세 부과 위험 (신고 불성실, 원천징수 불이행 시)
•근로자의 연말정산 오류 발생
•국세청 수정 신고 요청 및 세무조사 리스크 증가
•세무 신고 신뢰도 하락

2. 지급명세서 불부합 주요 원인

① 근로소득 지급명세서 불부합
•연말정산 공제 항목이 국세청 간소화 자료와 다르게 반영됨
•급여 및 상여금 지급 내역과 신고 내역 차이 발생
•성과급, 수당, 복리후생비 등의 신고 누락

✅ 예시:
•근로자가 제출한 의료비 200만 원 중 회사가 100만 원만 반영
•연말 보너스를 지급했으나 지급명세서 신고 누락

② 퇴직소득 지급명세서 불부합
•퇴직금 지급 내역과 원천징수 신고 내역이 일치하지 않음
•퇴직금을 근로소득으로 잘못 신고하거나, 일부 금액이 누락됨

✅ 예시:
•퇴직금 지급 후 원천징수 내역을 수정하지 않아 국세청 자료와 불일치
•퇴직금을 중간정산한 내역이 최종 지급명세서에 반영되지 않음

③ 사업소득 및 기타소득 지급명세서 불부합
•프리랜서, 용역 계약자 등에게 지급한 소득이 신고와 다름
•지급명세서 제출 기한 내 신고하지 않음

✅ 예시:
•프리랜서에게 지급한 강의료를 기타소득으로 신고했으나, 국세청에는 사업소득으로 분류됨
•계약금 지급 후 지급명세서를 제출하지 않아 불부합 발생

④ 원천징수세액 신고 오류
•급여 지급 시 원천징수한 소득세가 실제 신고된 원천세와 다름
•원천징수 후 세액 변경이 있었지만, 수정 신고를 하지 않음

✅ 예시:
•급여 지급 시 소득세 10만 원 원천징수했으나, 국세청 신고 시 8만 원으로 잘못 기재
•원천징수 후 급여 정산 과정에서 추가 지급이 있었지만 반영되지 않음

⑤ 지급명세서 제출 지연 및 미제출
•지급명세서를 기한 내 제출하지 않거나 일부 내역이 누락됨
•회사 내부 착오로 지급 내역이 국세청에 보고되지 않음

✅ 예시:
•일부 직원의 급여 지급 명세가 누락되어 신고되지 않음
•원천징수 신고만 하고 지급명세서를 제출하지 않음

3. 지급명세서 불부합 해결 방법

✅ 1) 국세청 홈택스에서 신고 내역 확인
•국세청 홈택스에서 회사가 제출한 지급명세서와 근로자·사업자의 신고 자료를 비교
•불부합 내역이 있는지 사전 점검

✅ 2) 원천징수 및 급여 지급 내역 정리
•급여 및 상여금, 퇴직금, 수당 등 지급 내역을 다시 확인하고 신고 내역과 일치하는지 검토
•원천징수 세액이 정확한지 확인

✅ 3) 근로자 또는 프리랜서(사업자)와 지급 내역 확인
•지급명세서 불부합이 발생한 근로자 또는 용역 계약자와 지급 내역을 재확인
•필요 시 원천징수 영수증을 발급하여 지급 내역 안내

✅ 4) 국세청 수정 신고 진행 (필요 시)
•지급명세서 불부합이 확인되면 홈택스를 통해 수정 신고
•원천징수 세액 차이가 있다면 원천세 신고도 함께 정정

✅ 5) 향후 지급명세서 제출 오류 방지
•지급명세서 제출 전 내부 검토 절차 마련
•급여 및 소득 지급 후 즉시 지급명세서 제출 여부 확인

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->실제사례

국세청 홈택스에서
지급명세서 불부합 확인하는법
지급명세서 불부합 다시보기

불부합이 있는지 확인해보려면
원천세 신고 - 정기신고 로 들어가면 팝업창이 나옵니다.

“불부합 안내 바로가기” 를 누르면
해당 관련된 내용으로 페이지가 이동됩니다.

저의 사례 같은 경우엔

퇴직소득 불부합.  오류가 떴는데요!

퇴직소득 불부합은
원천징수이행상황신고서와
지급명세서가 상이해서 뜨는 오류입니다.

그 차이만큼 55,634,462 소명을 해야합니다.
팝업창에 친절하게 담당자 번호가 나와있어서
연락해보는게 빠른일 처리를 할 수 있는 방법이에요.



2023년 원천징수이행상황신고서 가
회사에서 신고한 데이터와 상이해서…
찾다가 애먹었는데

결국 전화를 해보니,
세무서 담당자와 유선상으로 한달한달 조회해서
숫자를 확인하니 틀린점을 바로 찾을 수 있었습니다.

결.론.은

• 원천징수이행상황신고서
잘못신고됨->수정

• 퇴직소득 지급명세서
12월귀속 1월지급 분 누락->재신고
(지급기준으로 12월까지만 집계하는 불찰을범함..
과소신고 가산세 1% 발생)

1) 2023년도 원천징수이행상황신고서를 수정하기.
2) 2023년 5월귀속 원천징수이행상황신고서를 잘못신고된게있어서 작년에 전산취소동의서를 발송했었는데 누락되어 다시 전산취소요청.
3) 수정반영할 퇴직소득 지급명세서 팩스로 재발송
(가산세 있다고 함)

지급명세서 제출기한이 지나고서는 홈택스 전산으로 신고는 안되고, 팩스로 세무서에 전송해서 지급명세서 수정제출 신고 했습니다.
(세무서마다 기준이 다르니 확인전화필수)

이렇게해서
지급명세서=원천징수이행상황신고서
동일하게 맞추어서 상황종료했습니다.

결론 및 회고!!
☆지급명세서 만만하게보지말자☆
얼마전엔 이자배당지급명에서 가산세 물었기에.
지급명세서 내년에는 꼭꼭 정확히 확인해야겠어요..!

*지급명세서 불부합 관련 자주 묻는 질문(FAQ)

Q1. 지급명세서 불부합이 발생하면 가산세가 부과되나요?

✅ 지급명세서 미제출 또는 지연 제출 시 가산세(미제출분의 0.5%)가 부과될 수 있습니다.

Q2. 지급명세서를 수정 신고하면 문제가 해결될까요?

✅ 네. 불부합 내역이 확인되면 국세청 홈택스에서 수정 신고하면 문제를 해결할 수 있습니다.

Q3. 지급명세서 불부합을 방지하려면 어떻게 해야 하나요?

✅ 지급명세서 제출 전 급여·퇴직금 지급 내역을 정확히 확인하고, 원천징수 내역과 일치하는지 검토해야 합니다.